از دیدگاه آقای فاضلی مهمترین مشکلات این اتحادیه نوسازی و بهسازی ماشین آلات صنعتی واحدهای تولیدی است.

یکی دیگر از مشکلات این انجمن کمبود مواد اولیه می‌باشد که این مسئله به دلیل مشکلات تحریم شدت یافته است.

 اما از دیدگاه آقای مجتبایی بزرگترین مشکل و معضلی که در بین 2,700,000 عضو انجمن نمود بسیاری دارد بی‌انضباطی مالیاتی است که در سال جاری به دلیل عدم توافق اداره دارایی با نمایندگان اصناف به وجود آمده است و دو عکس العمل منفی را با خود برای دولت و اصناف به بار آورده است.

اول بی‌اعتمادی اصناف و تولید کنندگان به عملکرد اداره دارایی و حاکمیت و نظارت بر اصناف می‌باشد.

دوم اینکه 50٪ از پیش‌بینی درآمدی که برای سال جاری از محل اصناف می‌شده است محقق نگردیده و تا حل مشکل محقق نخواهد شد. در سالهای گذشته اصناف با ارائه اظهارنامه 50٪ از درآمد پیش‌بینی شده را به صورت نقد در حین ارائه اظهارنامه واریز می‌نمودند که در سال جاری به دلیل عدم توافق اصناف فقط اظهارنامه‌ها را تحویل ادارات دارایی نموده‌اند و هیچ درآمدی از این محل عاید دولت نشده است. این عدم توافق بر بی‌اعتمادی اشاره شده بیش از پیش افزوده است و با حل این مشکل روال کسب کل می‌تواند به حالت قبلی بازگردد.